自80年代后期，继渤海、黄海、东海之后，南海区渔业资源出现明显衰退现象；近年来更是频频亮起红灯——
茫茫南海，汇纳百川，它那坦荡宽阔的胸怀曾是鱼类休憩嬉戏的乐园。然而，自80年代后期，南海区渔业资源继渤海、黄海、东海之后开始出现明显衰退现象；近年来，更是频频地亮起红灯。
广东省东莞市虎门镇渔业办公室主任陈茂荣对记者说：东莞号称鱼米之乡，珠江口是很好的渔场。以前，几十马力的小渔船，一年产量可达一万多担。然而近十几年来，单产急剧下降：一对600马力的拖网渔船，1987年每小时下网所得为550公斤，到1998年下降到112公斤。东莞市新湾镇渔业办公室从1987年至1997年对6艘拖网渔船进行监测，结果表明：主要品种平均时产，蓝园从400公斤降到104公斤；大眼鲷从12．8公斤降到4公斤；蛇鲻从20．7公斤降到12．3公斤；二长棘鲷从6．3公斤降到1公斤。在渔船作业能力有长足提高的情况下，单产仍然急剧下降。
渔获中优质鱼比重急剧下降，渔获质量越来越差也是一个严重的问题。由于优质鱼大多生长周期长，一经破坏，不易恢复，所以其资源下降速度远比其他鱼类为快。以前，南海鱼类品种十分丰富，凤尾鱼、鲥鱼、马蛟、白鲳、黄鱼等传统优质鱼成群结队，如今却难得一见。据广东省海洋与水产厅资环处调查：优质鱼类在渔获组成中所占比例连年下降，最典型的有断斑石鲈、印度无齿鲳、鱼、红笛鲷等。
另外，渔获个体偏小，性成熟提前也是资源衰退的表现。如蛇鲻，以往性成熟个体体长19厘米、体重100克以上，现在观察到的性成熟个体，体长仅10余厘米，体重仅50克左右。这种种质退化带来的后果更加令人忧虑。
综观整个南中国海，目前已基本上无新渔场可言，即使远至南沙边缘渔场，经过近10年开发，资源状况也已大不如前。
“一渔兴百业。”而渔业资源的衰退使渔船经济效益滑坡，渔民收入减少，相关产业也大受影响。
以广东省为例：1998年渔船的经济效益是改革开放以来最差的一年，渔船生产直接亏损面在70％以上，如果计入折旧，真正能盈利的渔船不足10％，致使部分渔船被迫停航，累计时间达两个月以上。渔业本来是收益较高的行业，但渔船效益的下降使渔民生活水平降低。
如何应对目前面临的形势？广东海洋渔业水产厅厅长李珠江认为：污染已成为威胁渔业资源的首要问题。如果说渔船数量的扶摇直上，捕鱼手段的花样翻新，监测仪器的日益先进，电毒炸鱼的屡禁不止，使鱼类惨遭浩劫，但毕竟还有漏网之鱼；而愈来愈严重的近海污染则危害更大，必须予以高度重视，及早进行综合治理。今年在南海首次实行休渔将大大缓解资源压力。此外还应立即堵住源头，停造新渔船，不论作业，不分大小一律予以禁止；特别是要严查“沙滩船厂”。这项措施最好能在全国范围内通过立法加以实现。同时辅以严格的旧船淘汰制度。切实加强渔业管理，制订更为严厉的法规，坚决打击电、毒、炸鱼等严重破坏生态和资源的行为。
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